Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMARCA4P51532 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms