Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BMI1P35226 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
BMI1P35226 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
BMI1P35226 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
BMI1P35226 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms