Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
OTX2P32243 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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