Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP1P29466 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP1P29466 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms