Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA4P13612 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms