Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GCSAMQ8N6F7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms