Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
KRTAP13-3Q3SY46 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms