Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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