Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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LSAMPQ13449 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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