Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ARID4AP29374 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ARID4AP29374 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms