Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP4AP20648 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms