Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CXCL2P19875 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms