Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SFTPCP11686 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SFTPCP11686 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms