Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLTAP09496 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CLTAP09496 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTAP09496 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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