Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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