Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SIX1Q15475 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SIX1Q15475 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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