Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1SQ13698 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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