Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RBP5P82980 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RBP5P82980 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RBP5P82980 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RBP5P82980 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms