Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ERVK-16P61578 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms