Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2BFSP57053 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms