Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HRCP23327 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HRCP23327 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HRCP23327 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HRCP23327 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms