Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SETSIPP0DME0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SETSIPP0DME0 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms