Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTMAP06454 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTMAP06454 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms