Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms