Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP4B1Q9Y6B7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP4B1Q9Y6B7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP4B1Q9Y6B7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms