Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1BQ9Y5K3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms