Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP20Q9Y2K6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms