Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RARRES3Q9UL19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARRES3Q9UL19 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms