Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNOT11Q9UKZ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNOT11Q9UKZ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms