Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ACAD8Q9UKU7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACAD8Q9UKU7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms