Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLS1Q9UJA2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLS1Q9UJA2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms