Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EBF1Q9UH73 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EBF1Q9UH73 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EBF1Q9UH73 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms