Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEPT3Q9UH03 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEPT3Q9UH03 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEPT3Q9UH03 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms