Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB4Q9UDY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB4Q9UDY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJB4Q9UDY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms