Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM8A1Q9UBU6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms