Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1AQ9UBC5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYO1AQ9UBC5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms