Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGFRNQ9P2B2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGFRNQ9P2B2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGFRNQ9P2B2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms