Protein–RNA interactions for Protein: Q9P021

CRIPT, Cysteine-rich PDZ-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIPTQ9P021 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
CRIPTQ9P021 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CRIPTQ9P021 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms