Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DLL3Q9NYJ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DLL3Q9NYJ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms