Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM260Q9NX78 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM260Q9NX78 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms