Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNIP2Q9NS61 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNIP2Q9NS61 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms