Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SERINC1Q9NRX5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SERINC1Q9NRX5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms