Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM1Q9NRU3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNNM1Q9NRU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms