Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
DUOX2Q9NRD8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DUOX2Q9NRD8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms