Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NECTIN3Q9NQS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NECTIN3Q9NQS3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms