Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCUBE2Q9NQ36 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCUBE2Q9NQ36 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms