Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRIP3Q9NQ35 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRIP3Q9NQ35 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms