Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VAT1LQ9HCJ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VAT1LQ9HCJ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms