Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XKR8Q9H6D3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XKR8Q9H6D3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms