Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDCBP2Q9H190 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SDCBP2Q9H190 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms